歷史
1.創建於清朝乾隆壬寅四十七年（西元1782年）
2.嘉慶元年（西元1786年）重建
3.民國74年月玲日經內政部公告指定為三級古蹟
4.民國9年月日收回最後一批經纏訟10年之屋
5.配合中正路老街整體風貌再現，民國91年3月19日開工動土興建鐘鼓及護室，民國93年4月24日舉行落成啟用典禮
自此福佑宮廟貌煥然一新，建物地坪面積也增加一倍以上
建築
本宮建物以道教為主體。分前殿（三川殿）、戲亭、正殿、兩廊與左右護室，後面為大禮堂。正殿中央奉祀媽祖，兩旁供奉左為觀世音菩薩，右為水仙尊王，龍邊新建護室，供奉文昌帝君（文昌殿）、六十甲子太歲星君（太歲殿），虎邊新建護室·供奉霞海城隍、關聖帝君、福德正神、虎爺（祈福殿）、歷代先賢（開山堂）。
本宮天上聖母顯現神蹟事紀：
1.光緒十年中法戰爭，法蘭西軍隊進犯淡水，鎮台孫開華祈求媽祖庇蔭，因及時獲得媽祖神助，而軍威大振·一舉擊退法軍。光緒十二年巡撫劉銘傳奏請賜匾，隨獲頒『翌天昭佑」匾額一面，現仍高掛在正殿中央。
2.民國61年農曆3月21日。本宮信徒張水元與諸漁民駕船出海作業·撒網後忽覺全船劇震，眾人相顧驚惶，迫作返航，於收網中·獲得菩薩一尊，隨即移奉至本宮，是日子夜，全廟突發震動，觀音菩薩神前，日米燈具連續搖晃一畫夜，經請示媽祖，獲示係歡迎地藏王菩薩進駐本宮。
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