明聖宮朔其主神關聖帝君之金尊由來，係分靈自宜蘭礁溪協天廟，本地先賢林聯禎原為礁溪協天廟元老，距今七十餘年前（約民國十餘年）自大陸福建分靈關帝金身，駐蹕礁溪，台灣光復後，民國三十五年，以九份盛產金礦，掘金人潮分湧而至，繁榮一時，酣熱持續不退，是時九份居民大都外地遷入而居，亟需建立精神信仰中心，林聯禎等人遂與協天廟情商，虔誠叩請關聖帝君二帝坐鎮九份，恭稱協天大帝，庇佑廣大善信。
草創初期以財源不足，僅容臨時搭建草堂，茅草覆頂，暫時避風雨，因陋就簡，殷勤奉敬，聖帝神靈顯化，聖蹟頻頻，是時現任宮主林維濱罹患奇疾，四處就醫，藥石罔效，誠心禱告聖帝，獲賜芋尾頭妙方，一經提煉服用後即告痊癒，纏身多年之病痛不再復發。消息不脛而走，遠近聞訊爭賭神顏，求籤問吉，信眾大增，遂於原址開壇濟世裨益世俗，南天聖意賜名「昭安堂」，善信有求必應，未幾草堂狹隘，不敷使用，鸞生鄭水柱順勢所趨，倡議改建，擲爻 請示聖意，連得三聖爻，親點後山吉地，諭示重建新廟，廣開濟世之門。既得聖諭，當時堂主陳登俊即邀集地方嫌量林聯禎、胡金火正鸞呂水生抄錄生謝德旺魏孔明鸞信林維濱楊壬葵黃辰川等共同擘化建廟事宜及分任堂內工作，俾尊南天玉旨，更名為「明聖堂」。
民國42年歲次壬辰，鸞信與台陽礦業公司交涉租賃廟地，於後山破土興建廟宇，並公推林南山為主理，劉石樹為會長推展廟務。民國70年，木造堂宇歷時已久，漸呈斑駁之象，復以香客日增，逢年節慶典廟庭即擁塞不堪，經堂生決議，組織管理委員會，公推劉石樹為堂主，林南山為主任委員，同年9月修繕工程完竣，殿宇規模大備。
民國72年，繼續擴建膳房及廟宇，民國74年春獲玉旨敕令興建玄靈玉皇寶殿，遂組織擴建委員會，到77年花月建竣，同年同月二日舉行「玄靈高上帝進座典禮」，新雕聖帝金尊高四尺二，巍峨帝德，光照寰宇，聖諭敕名「明聖宮」。
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